Основы биологической систематики и филогенетики

В ходе лекционного курса студенты получают общее представление о теории биологической систематики, таксономической практике в зоологии, истории биологической систематики, формировании подходов к изучению филогенетических связей между объектами живой природы, кладизме, зоологической номенклатуре, концепциях и критериях вида. Форма итоговой отчётности — зачёт.

 

Краткая программа курса

  • Вводная лекция.Зоологическая систематика как наука. Систематика, классификация и номенклатура. Значение биологической номенклатуры как языка науки. Универсальность, уникальность, стабильность названий таксонов. Основные этапы развития, задачи и перспективы зоологической систематики. Теории биологической классификации. Систематика и биоразнообразие.
  • Филогенетика как наука, краткая история, классическая и современная филогенетика. Разнообразие методов систематики и филогенетики: типологический, сравнительно-морфологический, кариологический, аллозимный (биохимический), молекулярно-генетический, включая баркодинг.
  • История биологической систематики 1.Начальные периоды познания природы человеком. Предсистематика. Биологические исследования в античную эпоху. Развитие формальной логики в Средние Века и ее влияние на систематику. Биологическая систематика в эпоху возрождения и новое время. Униноминальные, биноминальные, полиноминальные названия. Зачатки биноминальной номенклатуры.
  • История биологической систематики 2. Карл Линней и его реформа.Сущность таксономической и номенклатурной реформы К. Линнея. Типологический подход в систематике. Практический и теоретический вклад трудов К. Линнея. Тривиальные названия и биноминальная номенклатура.
  • История биологической систематики 3. Эволюционные подходы в систематике. Роль трудов Чарльза Дарвина в формировании подходов к биологической систематике. Формирование СТЭ и новой систематики, работы Эрнста Майра.
  • История биологической систематики 4. Вилли Хенниг и формирование подходовкладизма. Хенниговакладистика как идея. Влияние кладизма на биологическую систематику во второй половине ХХ века. Процедура и методология кладистического анализа.
  • Зоологическая номенклатура 1. Международная комиссия зоологической номенклатуры, ее роль в стабилизации систематики. Международный кодекс зоологической номенклатуры, принципы его организации и сфера применения. Другие номенлкатурные кодексы. Содержание кодекса. Общие правила образования названий таксонов. Уровни систематической иерархии (ранг таксонов). Названия видов и внутривидовых таксонов; родов и подразделений родов; таксонов рангом выше рода. Общие правила правописания названий таксонов. Систематические категории и систематические единицы.
  • Зоологическая номенклатура 2.Общие правила образования названий таксонов. Названия видов и внутривидовых таксонов; родов и подразделений родов; таксонов рангом выше рода. Общие правила правописания названий таксонов. Правила обнародования названий. Эффективное и действительное обнародование. Новое название и новая комбинация.
  • Зоологическая номенклатура 3. Типификация в зоологической систематике.Типификация. Номенклатурные типы вида и внутривидовых таксонов. Голотип, синтипы, паратипы, лектотип, паралектотип, неотип, гапантотип, топотип. Типификация родов и подразделений родов. Типификация названий таксонов рангом выше рода. Номенклатурные и таксономические синонимы. Принцип приоритета. Действие принципа приоритета и его ограничения. Консервация названий. Законные названия и синонимы. Излишние названия. Омонимия, тавтонимы. Сохранение и восстановление названий. Цитирование фамилий авторов и дат публикаций при названиях таксонов. Специальные термины в номенклатурных цитатах.
  • Основные взгляды на концепции вида. Реальность вида.Концепции вида и критерии вида. Видообразование, аллопатрическое, парапатрическое, симпатрическое. Изоляция. Типологическая концепция вида. Биологическая концепция вида и ее ограничения. Когезионная концепция вида. Распознавательная концепция вида. Экологическая концепция вида. Эволюционная концепция вида. Филогенетическая концепция вида. ДНК-баркодинг как метод оценки разнообразия.

 

Литература

 

Основная:

Darwin, C. On the origin of species by means of natural selection. — London : Murray, 1859. — ISBN 8420656070/

Международный кодекс зоологической номенклатуры. Издание четвертое = InternationalCodeofZoologicalNomenclature. FourthEdition / Принят Международным союзом биологических наук.: Пер. с англ. и фр. И. М. Кержнера. — Изд. 2-е. — М.: Т-во научных изданий КМК, 2004. — 224 с. — ISBN 5-87317-142-4.

Coyne J.A., Orr H.A. Speciation. University of Rochester. Sunderland, MA: Sinauer Associates, 2004. Pp. xiii + 545.

Майр Э. Систематика и происхождение видов с точки зрения зоолога. М., 1947;

Майр Э. Методы и принципы зоологической систематики. М., 1956 (совместно с Э. Линсли и Р. Юзингером);

Майр Э. Зоологический вид и эволюция. М., 1968;

Майр Э. Принципы зоологической систематики. М., 1971;

Майр Э. Популяции, виды и эволюция. М., 1974.

Павлинов И.Я. 1989. Методы кладистики. М.: изд-во МГУ. 119 с.

 

Дополнительная:

Павлинов И. Я., Любарский Г. Ю.. 2011. Биологическая систематика: эволюция идей. Сборник трудов зоологического музея МГУ. Т. 51. Т-вонауч изд. КМК. C. 3–676.

Павлинов И. Я. 2013.История биологической систематики: эволюция идей. Palmarium. 476 p.

Павлинов И. Я. 2013.Таксономическая номенклатура. 1. От Адама до Линнея.

Павлинов И. Я. 2014.Таксономическая номенклатура. 2. От Линнея до первых кодексов.

Павлинов И. Я. 2015.Таксономическая номенклатура. 3. Современные кодексы.

Павлинов И. Я. 2015. Номенклатура в систематике.

Павлинов И.Я. 2005. Введение в современную филогенетику. М.: Тов. науч. изд. КМК. 391 с.

Павлинов И.Я. (ред.). 1996. Современная систематика: методологические аспекты // Сборник трудов Зоологического музея МГУ. Т. 34. 238 с.

Павлинов И.Я. 1990. Кладистический анализ (методологические проблемы). М.: изд-во МГУ. 160 с.

Любарский Г.Ю. 1996 Архетип, стиль и ранг в биологической систематике. КМК ScientificPress Москва, 432 с.

Mayr, Ernst (1991). Principles of Systematic Zoology. New York: McGraw-Hill, p. 159.

 

Составитель – кандидат биологических наук, доцент Николай Андреевич Поярков